Федеральное государственное учреждение "Агентство "Лён" создано 30 ноября 2001 года. В рамках административной реформы в 2011 году преобразовано в Федеральное государственное бюджетное учреждение «Агентство «Лён».
Сортовые посевы льна-долгунца в 2017 г. (% от посевной площади)