Федеральное государственное учреждение "Агентство "Лён" создано 30 ноября 2001 года.
В рамках административной реформы в 2011 году преобразовано в Федеральное государственное бюджетное учреждение «Агентство «Лён».
Валовой сбор льна-долгунца в Российской Федерации, тыс.тонн